A bela Guerilla legénysége szépen, csendben dolgozik a Killzone második felvonásán és jó ideje nem is mutattak semmi készülő produkciójukból, melyben ismét ádáz csatát kell vívnunk a Hellgastokkal. A történet szerint ezúttal nem az első rész vérrel átitatott Vektán bolygón kell csatába vonulnunk, hanem a Helghast nép által lakott Helgha bolygón fog játszódni a sztori. Hősünk Sev lesz, az Interstellar Strategic Alliance (ISA) Special Forces légiójának Alpha szakaszának parancsnoka, akinek feladata, hogy csapatával megsemmesítő csapást mérjen az ellenségre.