Az Assassin's Creed Shadows egy újabb vitás ügybe keveredett, miután egy játékos a játékban lerombolta az Itate Hyozu szentélyt, ami komoly felháborodást váltott ki a közösségben. A felvételen Yasuke kardjával pusztítja el a szentély különböző elemeit, beleértve az oltárt is, ami egyesek szerint tiszteletlenség a japán kultúrával szemben.
A japán Sankai News jelentése szerint - amelyet az Automaton idézett - a szentély képviselői közölték, hogy "megfelelő lépéseket" fognak tenni a játék ellen. Ugyanakkor az Insider Gaming szerkesztője, Mike Straw, később egy szerkesztői jegyzetben figyelmeztetett, hogy az eredeti forrás gyakran közöl hamis és túlzó híreket, ezért a jövőben nem fognak tőlük további értesüléseket átvenni.
A szentély képviselője azt is elmondta, hogy Ubisoft nem kereste meg őket a helyszín felhasználásával kapcsolatban. Hozzátette, ha megkeresték volna őket, biztosan megtagadták volna az engedélyt. Az azonban továbbra sem világos, hogy pontosan milyen jogi vagy egyéb intézkedéseket terveznek a játék ellen.
A közösség reakciója megosztott. Egyesek szerint a szentély lerombolása tiszteletlenség, és a játékosoknak nem lenne szabad megsemmisíteniük szent tárgyakat. Mások viszont azzal érvelnek, hogy a döntés a játékos kezében van, hiszen ők irányítják a karaktert. Néhányan felhozták példaként, hogy az AC II-ben ökölharcot lehet vívni a pápával, és a sorozat évek óta tartalmaz történelmileg és vallásilag jelentős helyszíneket. Az Insider Gaming megkereste az Ubisoftot a témában, de egyelőre nem kaptak választ.