Eddig voltak a jók és a gonoszok - egyszerű volt a képlet...
Most azonban a City of Heroes: Going Rogue segítségével a jó karakterek gonosszá válhatnak, a gonoszok jókká - ez persze egy hosszú folyamat, de rengeteg új quest és sztori-vonal segítségével lehet fokozatosan lesüllyedni a gonoszág bugyraiba vagy felemelkedni a jóság parnasszusára. Ez természetesen a kinézet megváltozásával is jár majd.
Akik esetleg nem tudják eldönteni, jók vagy gonoszak akarnak lenni a játékban, azoknak létrehoztak egy "semleges" szervezetet, a pretóriánusokat. Így aztán azok is tudnak kalandozni, fejlődni, akik esetleg egyik frakcióhoz sem akarnak tartozni. A többi infót érdemes a City of Heroes: Going Rogue videóból érdemes megnézni: