A Prototype 2-ben James Heller őrmester szerepében kell bosszút állnunk a családunk meggyilkolásáért, és megakadályozni a Blacklight vírus továbbterjedését.
A legújabb trailerben megtekinthetjük, hogy nagyjából hogy fogjuk ezt véghezvinni. Hagyományos katonákkal és nagyra nőtt mutánsokkal egyaránt meg kell küzdenünk bevetve emberfeletti képességeinket és a környezet elemeit. Újdonságként barátságos háziállatok is segítségünkre lesznek, hogy míg mi a fontosabb dolgokkal vagyunk elfoglalva ők "lefoglalják" a gyengébb, minket csak hátráltatni próbáló ellenfeleket. A Prototype 2 jövő áprilisban érkezik PlayStation 3-ra, Xbox 360-ra és PC-re.