Nem csak a dobozos Star Trek Online lesz ellátva mindenféle földi - vagy űri - jóval. A Star Trek Online Digital Deluxe Edition kifejezetten az online boltok rajongóinak készül, és öt egyedi extrával szolgál számukra.
A Star Trek Online Digital Deluxe Edition ára 59,99 dollár, ami egy kicsivel kevesebb, mint a dobozs extra kiadásé. Tartalma viszonylag impozáns, hiszen itt most csak ingame dolgokról beszélünk. Aki online vásárol az alábbi extrákat kapja:
- Három eredeti Star Trek egyenruha (kék, piros, sárga)
- Exkluzív "KHAAAAN" emote
- Exkluzív "Klingon Blood Wine Toast" emote
- Egyedi "NX" jelzés a játékos hajóján
- Automated Defense Battery a játékos hajóján.