A BioWare már a Mass Effect 2007-es megjelenése környékén hangoztatta, hogy trilógiát tervez, jövő márciusban pedig bezárul a kör, Shepard parancsnok és legénysége a végső ütközetre készül a Reaperekkel, amihez annyi szövetségest kell szereznie, amennyi csak lehetséges.
Hogy pontosan miként ér véget a történet a Mass Effect 3-ban, nem tudjuk (szívből reméljük, hogy nem lövi le a poént egyetlen szószátyár fejlesztő sem), az viszont már nem titok, hogy ha rosszul keverjük a lapokat, Shepard nem csupán otthagyja a fogát, hanem még az inváziónak sem sikerül gátat szabnia.
A trilógia tehát lezárul, az univerzum viszont továbbél a BioWare elképzelései szerint. Dr. Ray Muzyka elárulta, a Mass Effect 3 nem csupán Shepard történetének vet véget, hanem lehetőséget biztosít új játékosok bekapcsolódására, illetve egy új kezdetet is jelent. Shepard parancsnoknak viszont már nem jut hely az ezután következő játékokban.