Shepard koma tulajdonságai ugyanis nulláról indulnak megint. A BioWare szerint a Mass Effect 2 sztorija majd magyarázatot ad arra, miképpen lett a hősies Shepard parancsnok újfent mazsola, és nem kell félni attól, hogy a szokásos amnézia műsorszámot kapjuk az arcunkba.
A BioWare olyan szinten átvariálta az egész fejlődésrendszert, és a tulajdonságokat, hogy egyszerűen képtelenség lett volna az első részben megszerzett skilleket a Mass Effect 2-be implementálni. Azért a mentett állásainkat ne dobjuk el, hiszen például a beállítottságunk megmarad, nem kell újra összegyűjteni a renegade pontokat. Aztán ugye az is számít, a régi csapatból ki maradt életben, és ki az aki elhullott.